Ore no Imouto ga Konna ni Kawaii Wake ga Nai

Kousaka Kyousuke, un lycéen de 17 ans, est en froid avec sa petite sœur Kirino ; ils n'ont pas eu une seule vraie conversation ces dernières années.

Un jour, Kyousuke trouve par hasard le boîtier DVD d'un anime pour enfants intitulé "Stardust ☆ Witch Meruru" chez lui. Il est d'autant plus surpris lorsqu'il remarque qu'à l'intérieur du boîtier, il y a le CD-ROM d'un eroge. Les choses tournent mal puisque la personne la plus susceptible de posséder un tel objet pornographique, c'est lui (il a bien quelques magazines, mais c'est tout). Il découvre plus tard que le boîtier DVD ainsi que le jeu rangé à l'intérieur sont à sa petite sœur. Elle lui avoue alors qu'elle aime adore les petites sœurs, au point d'avoir acheté des centaines d'eroges avec comme personnage central une petite sœur et d'autres articles similaires. Pour faire simple, il découvre que sa petite sœur est une otaku obsédée par les petites sœurs.

Et maintenant, Kirino veut que son frère lui donne des conseils de vie ...

Ainsi s'achève la vie normale et sans danger de Kousaka Kyousuke.